نارضایتی هواداران سیتی نسبت به یوفا حتی به عقبتر برمیگردد، و اختلافات فراوانی با مدیران ارشد اروپایی وجود دارد.
در سال ۲۰۱۲، پس از شکایت سیتی به دلیل توهین نژادپرستانه نسبت به مهاجم ماریو بالوتلی به سازمان برگزاری، پورتو حدود ۱۷۰۰۰ پوند از سوی یوفا جریمه شد.
در همان فصل، سیتی به دلیل یک دقیقه تاخیر در بازی با اسپورتینگ در نیمه دوم، حدود ۲۴۰۰۰ پوند جریمه نقدی دریافت کرد.
در سال ۲۰۱۴، یوفا سیتی را به دلیل شکست در قوانین بازی جوانمردانه مالی (FFP) ۴۹ میلیون پوند جریمه کرد و تعداد تیمش را برای لیگ قهرمانان اروپا محدود کرد.
شش سال بعد، دادگاه حکمیت ورزش (Cas) محرومیت دو ساله سیتی از رقابتهای باشگاهی اروپایی را پس از پاکسازی آنها از "تبدیل وجوه سهام به عنوان کمکهای اسپانسر" لغو کرد – یوفا در ابتدا اعلام کرد سیتی بین سالهای ۲۰۱۲ تا ۲۰۱۶ "نقض جدی" مقررات FFP را مرتکب شده است.

